运用cDNA微阵列技术筛选乳腺癌相关候选

概要

乳腺癌是女性中最常见的癌症。WHO的最新数据显示，年有万新确诊病例，占所有的癌症的25%。虽然过去几十年预防和治疗方法有了很大改进，但乳腺癌仍是发展中国家女性与癌症相关死亡的首要原因。

致癌基因的激活和过表达以及抑癌基因的表达下降或缺失被证实在乳腺癌的发展中起重要作用。虽然很多分子遗传学和分子生物学研究显示多个基因和因子参与了乳腺癌的发病过程，但其确切机制尚不明确。因此，有必要探索新的基因或因子，作为预后、敏感性、治疗效果预测的生物标志物。

本研究用cDNA微阵列分析比较了7例乳腺癌患者的乳腺癌组织以及正常乳腺组织的基因表达谱。患者的一般特征见表1。

筛查结果显示乳腺癌组织中有个基因的表达与正常乳腺组织有显著性差异（P0.05），包括个上调基因和个下调基因。在这些差异表达的基因中，36个基因上调了5倍，如PTTG1,CDC2,KIAA,DLG7,NUF2,SP,TPX2和IFI30。

为厘清乳腺癌组织和正常乳腺组织基因表达谱之间的差异，我们在已检出基因的基础上对14个组织样本进行了聚类分析。结果见图1。乳腺癌组织的基因表达谱与正常乳腺组织有部分不同，显示两组之间存在差异。

图1乳腺癌组织和正常乳腺组织基因表达的聚类分析结果。聚集在红色区域的表达值表示上调，绿色区域表示下调。

为探索可能参与乳腺癌发病机理的生物通道，我们进行了分层聚类，然后对差异表达基因进行了基因本体（GO）分析。GO分析是以分子功能和生物过程为基础的，显示了很多不同的功能组。乳腺癌组织与正常乳腺组织相比，细胞增殖、细胞周期、细胞分裂、有丝分裂、细胞凋亡以及免疫应答基因在上调基因中更丰富，而细胞粘附、蛋白水解和转运基因在下调基因中更丰富。多个代表性的和重要的生物过程参与了免疫功能、细胞增殖、细胞粘附和凋亡（相关差异表达基因见表2-5）。

本研究还采用实时PCR对一个代表基因IFI30进行了分析，结果显示乳腺癌组织中的IFI30mRNA与相邻的正常乳腺组织相比显著增加（P=0.），与cDNA微阵列分析的结果相符（图2）。

图2通过定量实时PCR观察IFI30来验证差异表达基因

本研究通过比较乳腺癌组织和正常乳腺组织的基因表达谱，发现了一系列差异表达基因，多数基因有可能在乳腺癌的发病或发展过程中起重要作用。因此，本研究为将来探索乳腺癌潜在的生物标志物或治疗靶点提供了候选基因。

文献来源：

XiangYJ,FuQY,MaZB,etal.ScreeningforcandidategenesrelatedtobreastcancerwithcDNAmicroarrayanalysis.ChronicDiseasesandTranslationalMedicine,,1(02):65-72.

慢性疾病与转化医学（英文）（ChronicDiseasesandTranslationalMedicine,CDTM)是中华医学会系列杂志，创刊于年，致力于报道慢性疾病和转化医学最新研究进展，是季刊，开放获取（openaccess）的杂志。CDTM网址：







































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