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NCBI使用系列三查找已经公布的引
运用STS查找已经公布的引物序列还是使用人的IL6基因为例,呵呵一、打开NCBI主页,在Search后面的下拉菜单选择UniSTS,在FOR后面填写目的基因。操作完毕如图所示:
点击GO以后出现以下页面,
这是你会发现NCBI又提供了很多序列,下面我们还是要初步筛选我们需要的序列。二、根据物种、目的阴物所在染色体的位置等选择相应序列(可能不只一个),点击。下面以点击第一个进入的画面为例。
你会发现这个页面直接就给出了引物序列,PCR之后的片段长度也是给了的(bp)。下面还有很多相关的信息……
三、点击GeneBankAccession后面的代码,进入下一个页面。
啊!前后引物都呈现在眼前了,还有反应体系和反应条件!其中PrimerA是前引物序列,PrimerB则是后引物序列,并且给出了他们在DNA序列中的位置。有兴趣的朋友可以在序列中找一下,是可以找到的,不过要注意,PCR是双链扩增,在序列中可以直接找到的是PrimerA的原序列和PrimerB的互补序列。在步骤二里面我只点开了一个序列,继续打开其他的可能还会有对自己有用的引物,不过这要你自己慢慢发掘了。这种寻找引物的方法有点投机取巧的味道,实用程度不是很高,但如果这里面恰好有你想P的片段的话,恭喜你,这些引物都是很成熟的引物,可以直接拿过来使用了。如果想寻找引物,大家可以查阅相关论文,已经报道的引物我们为什么不用呢?!既省时间,可靠性又强。如果这两种方法都不能找到你需要的引物的话,那就自己设计吧,建议使用Primer5和Oligo。引物设计的详细内容在这里就不多说了,推荐两个帖子给大家看一下。北京哪家医院治疗白癜风好点北京看白癜风哪里医院比较好