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感冬不敢冻，派森诺双12暖心回馈
（文末有彩蛋）
基于PacBio三代测序平台的全长转录组测序（Iso-Seq），可直接获得mRNA的全长序列，可更为精准地解读mRNA的结构信息。
Ⅰ
应用范围
获取mRNA全长序列
同源异构体分析
单碱基变异
可变剪接分析
检测融合基因
等位基因识别
Ⅱ
派森诺优势
完善的样品提取检测方案，保障mRNA的完整性
根据具体物种，绘制转录本长度分布图，提供个性化的文库长度选择方案
派森诺拥有PacBioRSII及PacBioSequel单分子测序平台，提供一站式测序服务
专业的分析团队，提供个性化分析内容
Ⅲ
文献解析
利用全长转录组测序技术揭示高粱转录组复杂性
1
研究背景
mRNA前体常会进行可变剪接（AS）和可变多聚腺苷酸化(APA)，增加了转录组的多样性。高粱（Sorghumbicolor）的基因组测序于年完成，但转录组并没有得到较好的注释，还存在由短读长导致的低质量转录本注释错误，阻碍了AS和APA事件的研究。本文利用Pacbio全长转录组测序技术改进了高粱基因组的注释，该技术在AS和APA事件的研究中体现出巨大的优势。
2
实验方法
供试样本
高粱BTx品系的幼苗，实验分为干旱胁迫处理组和对照组，共2例样本。
文库构建
分段建库，以避免由于片段长度导致的系统偏差。
文库长度分布
1-2kb，2-6kb。
数据量
共测28个SMRTCell。
3
研究结果
实验共得到1.84MReadsofInsert，其中0.88M为全长ReadsofInsert。
可变剪接事件分析
本研究发现10,isoform经历了AS事件，远高于先前报道的1,个基因。证实高粱中存在的AS事件比之前的认知更为普遍。并发现在非生物胁迫下，isoform出现差异。文章对多isoform的基因进行RT-PCR验证，证实了结果的可靠性。
图一可变剪接事件分析
可变多聚腺苷酸化事件分析
APA事件是在编码区或3’-UTR区形成isoform，提高转录本的复杂性。由于单分子测序技术利用OligodT引物合成cDNA，poly（A）会出现在测序结果中，因此，单分子测序技术是研究APA的有力工具。本文发现在已表达的14,个基因中，11,个至少有1个poly(A)位点。
图二可变多聚腺苷酸化事件分析
4
参考文献
SalahE.Abdel-Ghanyetal.Asurveyofthesorghumtranscriptomeusingsingle-moleculelongreads.Nature北京白癜风医院北京白癜风医院
