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实验技术PCR结果不太好来这里找找



PCR常见问题

聚合酶链式反应(PCR)作为一项体外特异性扩增DNA的实验技术,在分子生物学研究中扮演着极其重要的角色。然而在日常实验中,并不是每次PCR反应都能得到满意的结果,总是会多多少少出现一些问题。下面就PCR中经常出现的问题做一个简单总结,以期能为大家今后的实验提供一点帮助。

扩增不出条带,假阴性

扩增不出条带的原因有多个,在保证PCR加样过程、仪器、PCR反应体系没有问题的情况下,考虑以下几个原因:

1模板

考虑模板质量是否出现问题,是否降解;是否含有杂质及酶抑制剂等。

2酶

酶活性是否丧失。

3引物

引物本身的质量及上下游引物的浓度是否对称;设计的引物过短,不能与单链DNA结合。

除以上原因,反应体系中的退火温度也是影响PCR扩增效率的重要因素,退火温度不要太低,太低会导致非特异性扩增;也不要太高,太高会影响引物与模板DNA的结合。下图从左至右,泳道1为Maker、泳道2条带扩增失败、泳道3非特异性扩增且无目的条带。

假阳性

假阳性指扩增出的条带并非想要的目的条带,问题在于扩增序列与非目的序列之间有同源性,需要重新设计引物,增加引物长度。可以考虑使用巢式PCR。

出现非特异性条带

1扩增过程中引物之间形成引物二聚体,解决办法为适当减少引物量。

2退火温度过低,出现非特异性扩增,可以设置梯度筛选最佳退火温度。

3减少酶量,减少循环次数等。

条带不规则整齐

1条带呈现波浪状,出现这种情况的原因多半是由电泳时电压过大引起的。

2条带呈拖尾或弥散状,这种情况可能是由于点样过程太慢,导致原液在点样孔中停留时间太久;点样过多;还有就是电压要合适。

如图就是条带弥散。

胶很白,条带不亮

出现这种情况的原因是在煮胶的时候不充分,胶没有完全溶解;DNA染料加的太多。对策:在煮胶的时候最好不要用高火,用中高火或者中火慢熬,使琼脂糖完全溶解于缓冲液之中;DNA染料不要加太多,goldview每ml缓冲液加1ul即可。对比看下图

以上是对PCR过程中出现的一些问题的总结,欢迎提出修改建议!

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