如果别人的引物好用,那就拿过来直接用

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有点对不住大家，上次更新都是在九月份了。因为最近在调整自己的节奏，所以有些时候有些慌乱，还没有完全的适应。我发现我自己随着年龄慢慢变大后，发现很难适应一个新环境以及融入一个新的时间表中。这是不是因为上了年纪以后，随着自己更多方面，什么好的、坏的东西的慢慢积累，所以不咋能接受新的东西，感觉就像是在慢性感染或者癌症中T细胞耗竭一样，但在耗竭的细胞中还是有一部分前体细胞可以接受新的抗原刺激分化（果子：这一段话是因为新到一个课题组，学了很多新的概念）。

这说明其实在我的环境中还有很大的发展空间，另外我们还需要及时清空自己的库存，归纳总结所有的东西后，扔了那些自己不用的东西，这样能更好的接收新生的事物。我正在进行实践中，希望有所收获。我记得是年的10月14日我开始更新了自己的第一个帖子，那个时候觉得怎么能更新到一年呢，想想真的是不可思议。感谢果子老师给我这样一个机会可以把自己所学归纳总结成文，锻炼了我的逻辑思维能力。所以建议大家可以把自己所学所知道的东西记录下来，只有有了记录才能证明它存在过，证明你来过(果子:这句话赵飞的版本是，没有记录就没有发生)。让我们一起加油啊。

重庆最近开始进入了那个不怎么能见到太阳，空气中湿湿的环境了。所以出太阳的时候要珍惜好时光，出去晒晒太阳。今天早上出门的时候，刚下过雨，天气清朗(果子:看照片感觉你对这个词有误解)，灰蒙蒙的，不像之前几天早上出门的那种雾蒙蒙的感觉，反正今天早上一直响起的旋律就是天青色等烟雨而我在等你。

下面进行今天的分享，我们在上一个帖子中主要讲了分子克隆PCR引物的设计一般规律。我觉得豆子老师在讲怎么设计引物时已经讲得非常到位了，自认为不会知道的更多，所以我就不讲怎么用软件设计引物了。我主要跟大家分享我们怎么在网上找寻现成的引物（主要是qPCR）。

人的基因

GeneCards可能大部分人都知道有GeneCards这个网站可以查询人类基因，但是可能还是有少部分正在看帖子的不知道这个网站。所以在此我先简单的介绍一点相关的知识。我们首先在网址中输入“”genecards”（要是可以用Google，要是不行我试过用qq浏览器或必应或火狐都可以）下图是它的一个首页，从下图我们可以看到人家标榜的就是TheHumanGeneDatabase。

genecards.png那怎么应用他呢，在左上角的keywords搜索框里面搜你感兴趣的基因。（这里可以以keywords搜索，可以是symbols，或者symbols/aliases以及symbols/aliases/identifiers，或者蛋白名。具体检索，看个人喜欢，像我这种就非常喜欢简单粗暴的关键词检索）。下面我就举一个例子。

比如我想查询糖皮质激素受体的信息（蛋白名字glucocorticoidreceptor，简写GR，基因名字为NR3C1）

输入GR

从上图我们可以看到你输入GR后第一个出来的也是它的基因名，在score那一行有一个匹配度，分数越高和你输入的越匹配。输入NR3C1我们可以看出直接输入以后，第一个就是你想要的。其实从输入的基因或蛋白的匹配度这里还可以看出哪些基因或蛋白与你输入的这个基因有关联性。如下图，要是对GR研究多的人会发现，下面的那些基因与GR或多或少都有联系，要不就是他的Chaperone（HSP90AA1），或者相互作用蛋白（GSR），或者调控的蛋白（BCL2A1)。是不是很有意思找引物GeneCards其他的功能我就不细讲了，主要讲怎么用它寻找引物。我们也已GR为例。点入NR3C1，如下图：看到黄色的Expression，点击进去后往下翻如下图：

这时你就可以看到primerproducts，再点击“qPCRprimerpairs”进去，如下图：

此外也可以点击“HPMP”这样就可以找到商业化的引物了。那这个时候我们需要验证这对引物是在GR基因的哪个位置，同样在那个引物的网址中下面的Assessionnumber或者上图的GeneID，点击回去后，可以进行比对，当然也可以用NCBIBlast进行比对。比对

下面我就用NCBIblast对GR的引物进行比对正向引物1.进入“NCBIblast”网站

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