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转基因小鼠的鉴定
一、从鼠尾中提取DNA
采用鼠尾基因组DNA提取试剂盒提取DNA,操作如下:
1.剪取小鼠长度为0.4-0.6cm的尾巴,放入灭菌后的离心管中,加入μLBufferGTT。震荡混匀。
2.加入20μLproteinaseK,涡旋震荡,彻底混匀。
3.置于56℃水浴,直到组织溶液完全清澈,一般需消化6-8h,赋予过程中涡旋震荡,使样品均匀分离。
注意:
1)如果赋予和涡旋震荡后仍然有胶状物质,必要时过夜消化再加入20μlproteinaseK消化,不会影响后续操作。
2)如需去除RNA,可在上述步骤完成后,加入4μl浓度为mg/μl的RNaseA溶液,震荡混匀,室温放置5-10min。
4.rpm离心1min,以消除未消化的类似于鼠毛等组织,将上清转移到一个新的灭过菌的离心管中。
5.加入μlBufferGL,涡旋震荡,充分混匀,加入μl无水乙醇,涡旋振
荡,充分混匀,短暂离心,使管壁上的溶液收集到管底。
注意:
1)加入BufferGL和无水乙醇后要立即涡旋震荡混匀。
2)如果多个样品一起操作,BufferGL和无水乙醇可以等比例混匀后一起加入样品。3)加入BufferGL和无水乙醇后可能会产生白色沉淀,不会影响后续操作。
6.将步骤5中所得到的溶液全部加入到已装入收集管的吸附柱中,若以此不能加完溶液,可分多次转入。00rpm离心1min,倒掉收集管中的废液,将吸附柱重新放回收集管中。
7.向吸附柱中加入μlBufferGW1(使用前检查是否已加无水乙醇),00rpm离心1min,倒掉收集管中的废液,将吸附柱重新放回收集管中。
8.向吸附柱中加入μlBufferGW2(使用前检查是否已加无水乙醇),00rpm离心1min,倒掉收集管中的废液,将吸附柱重新放回收集管中。如需进一步提高DNA纯度,可重复步骤8。
9.10rpm离心2min,倒掉收集管中的废液,将吸附柱置于室温数分钟,以彻底晾干。
注意:这一步的目的是将吸附柱中残余的乙醇去除,乙醇的残留会影响后续的酶促反应(酶切,PCR等)。
10.将吸附柱置于一个新的灭过菌的离心管中,向吸附柱的中间部位悬空加入50-μlBufferGE或灭菌水,室温放置2-5min,00rpm离心1min,收集DNA溶液,-20℃保存DNA。注意:1)如果下游实验对PH值或EDTA敏感,可以用灭菌水洗脱,洗脱液的PH值对洗脱效率有很大影响,若用水作洗脱液应保证其PH值在7.0-8.5直接,PH值低于7.0时洗脱效率不高。
2)离心前室温孵育5min可增加产量。
3)用另外的50-μLBufferGE或灭菌水再次洗脱可以增加产量。
4)如果需要提高DNA的终浓度,可以将步骤10所得的DNA洗脱液重新加至吸附膜上,重复步骤10;若洗脱体积小于μL,可以增加DNA的终浓度,但可能会减少总产量。
二、PCR
PCR程序设定:根据转基因类型及引物设计而改变
设定PCR反应体系
先在1.5ml的EP管中加入总的体系再平均分装入各个PCR管中(一般多加两小管的量),将移液器调到总量的1/3到1/2体积在EP管中缓慢抽吸若干次(尽量避免产生气泡)以便Taq酶混合均匀,最后再在各PCR管中依次加入DNA样品。
引物处理方法:引物合成后,EP管上会有标记,一般为xnmol,使用前先用10rpm离心1min,加入10xμlddH2O,涡旋振动混匀,微型离心机离心,即可得到μM的母液,取10μl的母液,用ddH2O稀释10倍,即加入90μl,混匀后即可得到10μM的引物工作液。
三、电泳
1.配胶:鉴定用的胶板有大、中、小3种,分别用的梳子为50、25、11齿。分别用的0.5*TBE的量为90ml、45ml、25ml。用1.5%的琼脂糖凝胶。
2.点样:12μl的DNA,Marker加5μl。点样时注意逐个点样,不要点错,最好把中间的那个孔留着点Marker,这样可避免点样的出错。Marker的选择依基因片段大小而定。
3.跑电泳:打开电源,v电压,30min左右即可。
4.照胶:看是否有目的条带,即可判断对应小鼠是阳性、阴性或是杂合子。
5.保存。